MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Arthrobacter phenanthrenivorans Sphe3 chromosome

Total Repeats: 10124

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_015145	TCA	2	6	4233911	4233916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10002	NC_015145	CAGG	2	8	4233973	4233980	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10003	NC_015145	GCC	2	6	4236857	4236862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10004	NC_015145	CGG	2	6	4236863	4236868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10005	NC_015145	CGG	2	6	4236878	4236883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10006	NC_015145	CAT	2	6	4236887	4236892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10007	NC_015145	AGG	2	6	4236918	4236923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_015145	GCG	2	6	4238578	4238583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10009	NC_015145	ACC	2	6	4238622	4238627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10010	NC_015145	GCT	2	6	4238633	4238638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10011	NC_015145	TGC	2	6	4238658	4238663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10012	NC_015145	CCG	2	6	4238710	4238715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10013	NC_015145	GCC	2	6	4238716	4238721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10014	NC_015145	GGCC	2	8	4238782	4238789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10015	NC_015145	AG	4	8	4239806	4239813	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_015145	GAA	2	6	4240182	4240187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_015145	CTT	2	6	4240215	4240220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10018	NC_015145	TC	3	6	4240223	4240228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10019	NC_015145	AAC	2	6	4240282	4240287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10020	NC_015145	TGG	2	6	4240322	4240327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_015145	GCT	2	6	4240389	4240394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10022	NC_015145	CT	3	6	4240408	4240413	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10023	NC_015145	AGT	2	6	4240442	4240447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_015145	GTT	2	6	4240456	4240461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_015145	GTGC	2	8	4240517	4240524	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10026	NC_015145	GAG	2	6	4240556	4240561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_015145	TTC	2	6	4240636	4240641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10028	NC_015145	GAA	2	6	4240686	4240691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_015145	TTC	2	6	4240704	4240709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10030	NC_015145	GGC	2	6	4240773	4240778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10031	NC_015145	TAG	2	6	4240802	4240807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_015145	GTGC	2	8	4240813	4240820	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10033	NC_015145	AC	3	6	4240838	4240843	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10034	NC_015145	GCT	2	6	4240870	4240875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10035	NC_015145	AGC	2	6	4240919	4240924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10036	NC_015145	GCCA	2	8	4240962	4240969	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10037	NC_015145	CGG	2	6	4241035	4241040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10038	NC_015145	CAA	2	6	4241073	4241078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10039	NC_015145	C	6	6	4241118	4241123	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10040	NC_015145	GCA	2	6	4241172	4241177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10041	NC_015145	GGC	2	6	4241191	4241196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10042	NC_015145	CTG	2	6	4241197	4241202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10043	NC_015145	GC	3	6	4241209	4241214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10044	NC_015145	AC	3	6	4241281	4241286	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10045	NC_015145	CGC	2	6	4241450	4241455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10046	NC_015145	CGT	2	6	4241490	4241495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10047	NC_015145	ATCA	2	8	4241527	4241534	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10048	NC_015145	ACG	2	6	4241623	4241628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10049	NC_015145	GGC	2	6	4241639	4241644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10050	NC_015145	GGCT	2	8	4241680	4241687	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10051	NC_015145	GTC	2	6	4241750	4241755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10052	NC_015145	TAG	2	6	4241802	4241807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_015145	ATG	2	6	4241820	4241825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_015145	GCCGGT	2	12	4241903	4241914	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10055	NC_015145	GGCC	2	8	4242014	4242021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10056	NC_015145	CTG	2	6	4242022	4242027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10057	NC_015145	AGA	2	6	4242043	4242048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_015145	CAGC	2	8	4242137	4242144	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10059	NC_015145	CG	3	6	4242199	4242204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10060	NC_015145	GCA	2	6	4242294	4242299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10061	NC_015145	CGC	2	6	4242302	4242307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10062	NC_015145	CGC	2	6	4242312	4242317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10063	NC_015145	CCCAT	2	10	4242371	4242380	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
10064	NC_015145	CGA	2	6	4242406	4242411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10065	NC_015145	CAA	2	6	4242448	4242453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10066	NC_015145	CGG	2	6	4242473	4242478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10067	NC_015145	GC	3	6	4242560	4242565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10068	NC_015145	CGA	2	6	4242572	4242577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10069	NC_015145	CCA	2	6	4242578	4242583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10070	NC_015145	CAGCG	2	10	4242594	4242603	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10071	NC_015145	CG	4	8	4242682	4242689	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10072	NC_015145	GCA	2	6	4242726	4242731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10073	NC_015145	AAGG	2	8	4242738	4242745	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_015145	GCAG	2	8	4242807	4242814	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10075	NC_015145	GTCGT	2	10	4242893	4242902	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10076	NC_015145	TGC	2	6	4242906	4242911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10077	NC_015145	TCA	2	6	4242914	4242919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10078	NC_015145	CCGAT	2	10	4242963	4242972	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10079	NC_015145	CAGG	2	8	4242988	4242995	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10080	NC_015145	GTT	2	6	4243092	4243097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_015145	TGC	2	6	4243111	4243116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10082	NC_015145	GCT	3	9	4243121	4243129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10083	NC_015145	AC	4	8	4243196	4243203	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10084	NC_015145	GGC	2	6	4243228	4243233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10085	NC_015145	CGA	2	6	4243288	4243293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10086	NC_015145	CAG	2	6	4243340	4243345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10087	NC_015145	CCA	2	6	4243460	4243465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10088	NC_015145	ATC	3	9	4243524	4243532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10089	NC_015145	TGC	2	6	4243538	4243543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10090	NC_015145	TGA	2	6	4243557	4243562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10091	NC_015145	GGAA	2	8	4243645	4243652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_015145	AGC	2	6	4243658	4243663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10093	NC_015145	CGGA	2	8	4243664	4243671	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10094	NC_015145	TGC	2	6	4243682	4243687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10095	NC_015145	CCA	2	6	4243821	4243826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10096	NC_015145	ATCGC	2	10	4243837	4243846	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10097	NC_015145	AGG	2	6	4243956	4243961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_015145	AGC	2	6	4244160	4244165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10099	NC_015145	AGT	2	6	4244178	4244183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_015145	CAGGA	2	10	4244221	4244230	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10101	NC_015145	GTCA	2	8	4244445	4244452	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10102	NC_015145	GAA	2	6	4244470	4244475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_015145	A	6	6	4244559	4244564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_015145	TCG	2	6	4244610	4244615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10105	NC_015145	TGGCC	2	10	4245935	4245944	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10106	NC_015145	CACT	2	8	4247048	4247055	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10107	NC_015145	TGC	2	6	4247072	4247077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10108	NC_015145	TGG	2	6	4247094	4247099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_015145	TGT	2	6	4249776	4249781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10110	NC_015145	GCC	2	6	4249801	4249806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10111	NC_015145	CGT	2	6	4249807	4249812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10112	NC_015145	GGC	2	6	4249814	4249819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10113	NC_015145	CAG	2	6	4249866	4249871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10114	NC_015145	GCA	2	6	4249951	4249956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10115	NC_015145	TC	3	6	4249963	4249968	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10116	NC_015145	TCG	2	6	4250044	4250049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10117	NC_015145	TA	3	6	4250066	4250071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_015145	GTT	2	6	4250113	4250118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_015145	CGG	2	6	4250235	4250240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10120	NC_015145	CGGC	2	8	4250256	4250263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10121	NC_015145	CTT	2	6	4250294	4250299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10122	NC_015145	CGG	2	6	4250307	4250312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10123	NC_015145	GTTA	2	8	4250342	4250349	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_015145	GAA	2	6	4250391	4250396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.